Algerian Journal of Health Sciences

Escherichia Coli Résistant à La Colistine : Prévalence, Caractérisation Phénotypique Et Moléculaire D’isolats Cliniques à L’ehu Oran, Algérie.

Auteurs : Dali Yahia Radia . Maazouz Imane . Kouskousou Lamia . Allami Nafissa . Mahmoud Yousra . Zitouni Hanane . Oualha Mohand Tahar .

Résumé

Contexte : La résistance à la colistine chez les Enterobacterales représente une menace majeure pour la santé publique, particulièrement dans les pays à ressources limitées. Cette étude visait à déterminer la prévalence et les mécanismes moléculaires de cette résistance chez Escherichia coli dans un centre hospitalier-universitaire algérien. Méthodes : Étude descriptive à recrutement prospectif (septembre 2025 – mars 2026) incluant 211 souches d'E. coli. La sensibilité à la colistine a été évaluée par CBDE puis confirmée par microdilution en bouillon (BMD) selon le CLSI. Des PCR multiplex ont été réalisées pour la détection des gènes mcr (1-5), qnr (A, B, S) et bla (TEM, CTX-M, SHV). Un typage moléculaire par ERIC-PCR a été effectué pour évaluer la diversité génétique et les relations clonales entre les souches résistantes à la colistine. Résultats : Sur 211 souches, 19 (9,0 %) étaient résistantes à la colistine (CMI ≥ 4 µg/mL), avec 73,7 % présentant des CMI basses (4-8 µg/mL). Les isolats résistants à la colistine étaient totalement résistants à l’ampicilline avec un phénotype PASE dominant (42,1 %), suivi de BLSE (31,6 %) et TRI (26,3 %). Aucune carbapénémase n'a été détectée. Le gène mcr-1 était présent chez 8 souches (42,1 %). Onze (11) souches (57,9 %) présentaient un mécanisme non-mcr. Parmi les 11 souches résistantes aux quinolones, qnrS et qnrB ont été détectés chez 2 et 1 souche respectivement. Chez les 6 souches BLSE, blaTEM était universel (100 %) et blaCTX-M était présent dans 50 % des cas. L'analyse ERIC-PCR a révélé une diversité génétique au sein des souches résistantes, permettant de visualiser les relations de parenté entre les isolats par construction d'un dendrogramme. Conclusion : Une prévalence de 9 % de résistance à la colistine a été observée, avec prédominance du mécanisme mcr-1. La co-résistance aux β-lactamines et fluoroquinolones souligne l'urgence d'une surveillance renforcée. L'approche ERIC-PCR a permis d'apporter des éléments complémentaires sur la structure clonale de ces souches multirésistantes.

Mots clés

Escherichia coli ; resistance ; colistin ; CMI ; mcr-1 ; molecular typing ; ERIC-PCR ; Algeria.